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科研服務

真核無參轉錄組測序

常見問題

  • 針對無參考基因組物種的轉錄組測序你們可以提供哪些分析內容?

    常規信息分析內容如下:

    1、序列拼接及拼裝統計;

    2、Unigene功能注釋;

    3、Unigene功能聚類分析;

    4、Unigene的代謝途徑分析;

    5、Unigene的表達差異分析(兩個或者兩個以上的樣本);

    6、樣品間差異表達Unigene的富集分析(GO、KEGG);

    7、樣品間差異Unigene的表達模式聚類分析(3個樣本及以上);

    8、SNP鑒定;

    9、SSR分析。

    除了常規信息分析外,還可根據客戶需求,進行可選性信息分析,例如:基因共表達網絡分析、PCA分析、差異mRNA蛋白互作網絡分析、轉錄因子分析(適用于植物物種)、樣本特異表達及共有表達基因分析、樣品間相關性分析、mRNA與miRNA互作分析、mRNA與LncRNA互作分析、DEU分析(適用于有生物學重復)。

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