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科研服務(wù)

真菌基因組de novo測序


真菌全基因組從頭測序(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是指對基因組序列未知或無近緣物種基因組信息的某個物種,構(gòu)建不同插入片段的基因組DNA文庫并對文庫進行序列測定,然后利用生物信息學(xué)方法進行拼接、組裝和注釋,從而獲得該真菌的全基因組序列圖譜。



產(chǎn)品參數(shù)



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1、簡單真菌:35% ≤ G+C% ≤ 65% 且雜合度 ≤ 0.5%且基因組 ≤ 40 Mb; 

2、復(fù)雜真菌:G+C% > 65% 或 G+C% <35%或雜合度 > 0.5%或基因組 > 40 Mb; 

   Contig N50:將組裝得到的 Contig  按序列長度從長到短排序并依次累加,當(dāng)累加長度正好到序列總長度  50%  時,最后一條序列的長度。


樣品要求



一、原樣類

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二、核酸類

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