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科研服務

CircRNA測序

常見問題

  • 為什么CircRNA測序的研究比較熱?

    1)多角度闡述分子生物學問題的需要;

    2)從新的角度發現導致樣本存在差異的需要;

    3)尋找影響疾病發生的分子標記;

    4)探究circRNA的未知功能;

    5)尋找導致microRNA表達發生變化的機理。

  • CircRNA測序需要多少數據量?

    推薦10G clean data/樣本的數據量。

  • CircRNA測序的條件?

    1. 有參考基因組,并且有CircRNA注釋信息;

    2. 有相應的核糖體去除試劑盒。

  • CircRNA有哪些特點?

    1. 大多存在于細胞質中,且序列高度保守;

    2. 一般細胞或組織中,環狀RNA較穩定,半衰期在48h,其他mRNA(線性)半衰期約為10h;血清中的外顯子環狀RNA不穩定,半衰期<15s。

    3. 不同細胞中表達的環狀RNA可能不同;

    4. 同一個基因可能即產生線性mRNA,又可以轉錄成環狀RNA;

    5. 總量估計,外顯子環狀RNA(exonic ciRcRNA)的量約為polyA mRNA(線性mRNA)的1%;占非核糖體RNA的0.8%;

    6. 大部分為ncRNA。

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